1.治疗用卡介苗在使用后可能发生“卡介苗全身性反应”，临床症状包括：发热39.5℃或39.5℃以上，持续12小时或12小时以上;发热38.5℃或38.5℃以上，持续48小时或48小时以上;肺炎、肝炎、外泌尿生殖器官机能异常，有活体组织检查的肉芽肿性炎症;或败血症的传统症状，包括循环不良，急性呼吸困难和散在的血管内血凝。2.治疗用卡介苗在使用后可能引起局部反应。灌注后，膀胱受药液刺激可出现尿频、尿急、血尿、排尿困难等症状。3.治疗用卡介苗在使用后可能出现低热。常在用药2～3小时出现，持续数天不等。不需停药，也不需治疗，能自愈。发生率较高，常有半数以上的患者可发生这类症状。4.有少数患者使用治疗用卡介苗后可自觉不适乏力，关节疼痛，体温达38℃以上。还有个别患者由于卡介菌侵入局部组织，细菌生长繁殖，引起尿道炎、前列腺炎、睾丸炎或附睾炎。5.极个别患者，因卡介菌经血液引起卡介苗性肺炎或肝炎。凡出现全身性反应的患者，均应立即停止用药，并用抗痨药，对症药等进行治疗。6.导致死亡报道：国外曾已报告两例使用卡介苗致死的病例，都与全身性卡介苗反应有关。一例与其前期肝脏酒精中毒，未注意导尿管创伤而腔内用药有关。第二例，可能与没有意识到全身性卡介苗反应，而继续进行卡介苗治疗有关。